{"id":4431,"identifier":"FK2/TSVDUS","persistentUrl":"https://doi.org/10.26249/FK2/TSVDUS","protocol":"doi","authority":"10.26249","publisher":"osnaData","publicationDate":"2025-03-11","storageIdentifier":"file://10.26249/FK2/TSVDUS","datasetVersion":{"id":88,"datasetId":4431,"datasetPersistentId":"doi:10.26249/FK2/TSVDUS","storageIdentifier":"file://10.26249/FK2/TSVDUS","versionNumber":1,"versionMinorNumber":0,"versionState":"RELEASED","lastUpdateTime":"2025-03-11T07:04:44Z","releaseTime":"2025-03-11T07:04:44Z","createTime":"2025-03-08T07:53:06Z","license":"CC0","termsOfUse":"CC0 Waiver","fileAccessRequest":false,"metadataBlocks":{"citation":{"displayName":"Citation Metadata","fields":[{"typeName":"title","multiple":false,"typeClass":"primitive","value":"Replikationsdaten für: Comparison of the diversity of prokaryotic communities between agricultural and uncultivated soils in the Osnabrück region"},{"typeName":"author","multiple":true,"typeClass":"compound","value":[{"authorName":{"typeName":"authorName","multiple":false,"typeClass":"primitive","value":"Oswald, Tom"},"authorAffiliation":{"typeName":"authorAffiliation","multiple":false,"typeClass":"primitive","value":"Microbiology AG Hensel"},"authorIdentifierScheme":{"typeName":"authorIdentifierScheme","multiple":false,"typeClass":"controlledVocabulary","value":"ORCID"},"authorIdentifier":{"typeName":"authorIdentifier","multiple":false,"typeClass":"primitive","value":"0009-0009-9085-2349"}}]},{"typeName":"datasetContact","multiple":true,"typeClass":"compound","value":[{"datasetContactName":{"typeName":"datasetContactName","multiple":false,"typeClass":"primitive","value":"Oswald, Tom"},"datasetContactAffiliation":{"typeName":"datasetContactAffiliation","multiple":false,"typeClass":"primitive","value":"Microbiology AG Hensel"},"datasetContactEmail":{"typeName":"datasetContactEmail","multiple":false,"typeClass":"primitive","value":"toswald@uni-osnabrueck.de"}}]},{"typeName":"dsDescription","multiple":true,"typeClass":"compound","value":[{"dsDescriptionValue":{"typeName":"dsDescriptionValue","multiple":false,"typeClass":"primitive","value":"As part of the master's thesis \"Comparison of the diversity of prokaryotic communities between agricultural and uncultivated soils in the Osnabrück region\" (Oswald, 2025), a total of 60 soil samples were taken from 20 agricultural and uncultivated sites (one triplicate each). The samples were analysed to identify similarities and differences in microbial and functional composition. Nanopore sequencing from Oxford Nanopore Technologies (ONT) and subsequent bioinformatic analyses were used to characterise the microbiome at each site. Agricultural practices (soil movement, type of usage), physico-chemical parameters (e.g. C/N ratio, pH) and climatic factors (soil moisture level) were included to identify explanatory factors for differences in α- and β-diversity and functional composition between sites. The most influential factor on microbial composition was found to be pH. In addition, a change in α-diversity was observed between tilled and no-tilled soils. While the composition of the microbiome and consequently the functional composition is similar between sites, hierarchical cluster analysis in combination with α-diversity and relative abundances of individual functions gives an indication of the formation of stable microbial communities in undisturbed soils. \n\nThe dataset provided here contains the recorded metadata for the sites, the microbiome data and the R script used to process the data, perform statistical tests and create graphics. It is recommended to read the readme.pdf first."},"dsDescriptionDate":{"typeName":"dsDescriptionDate","multiple":false,"typeClass":"primitive","value":"2025-03-08"}}]},{"typeName":"subject","multiple":true,"typeClass":"controlledVocabulary","value":["Medicine, Health and Life Sciences"]},{"typeName":"ddc","multiple":true,"typeClass":"controlledVocabulary","value":["570 - Life sciences"]},{"typeName":"depositor","multiple":false,"typeClass":"primitive","value":"Oswald, Tom"},{"typeName":"dateOfDeposit","multiple":false,"typeClass":"primitive","value":"2025-03-08"},{"typeName":"licenseApproval","multiple":false,"typeClass":"primitive","value":"on 2025-03-08, user toswald@uni-osnabrueck.de approved the following license text: <p><h3>Lizenzvereinbarung – Deposit License</h3></p><p>Hiermit gestatte ich der Universität Osnabrück, vertreten durch die Präsidentin/den Präsidenten, durchführende Organisationseinheit: Universitätsbibliothek (UB), vertreten durch die Leitende Bibliotheksdirektorin/den Leitenden Bibliotheksdirektor, meine digitalen Forschungsdaten einschließlich Abstract und Metadaten zu den unten genannten Lizenzbedingungen zur freien Nutzung im Internet bereitzustellen. Im Rahmen dieser Bereitstellung sind Nutzerinnen und Nutzer berechtigt, Forschungsdaten nach Maßgabe des Urheberrechts unentgeltlich zu nutzen, insbesondere, Forschungsdaten zum privaten und sonstigen eigenen Gebrauch herunter zu laden oder zu speichern. </p> <h4>Rechteeinräumung </h4> <p>Der Urheber/die Urheberin der Forschungsdaten räumt der Universität Osnabrück an seinen/ihren Forschungsdaten einschließlich Abstract und Metadaten zeitlich unbegrenzt und unwiderruflich das nicht ausschließliche Recht zur öffentlichen Zugänglichmachung, zur langfristigen Speicherung auf dem institutionellem Forschungsdatenrepositorium <i>osnaData</i> der Universität Osnabrück und zur Vervielfältigung zu diesen Zwecken ein. Der urheberrechtliche Schutz bleibt durch diese Lizenz unberührt. Die Universität Osnabrück behält sich vor, Forschungsdaten wegen inhaltlicher oder technischer Mängel oder eines ungeklärten rechtlichen Status abzulehnen. </p> <h4>Rechte Dritter </h4> <p>Der Urheber/die Urheberin der Forschungsdaten erklärt, dass mit der Bereitstellung seiner/ihrer Forschungsdaten und jedes Bestandteils (z. B. beschreibende Dokumentationen) keine Rechte Dritter (z. B. Miturheber, Co-Autoren, Verlage, Drittmittelgeber) verletzt werden. Insbesondere hat bisher kein Verlag oder sonstiger Dritter (z. B. Drittmittelgeber) ein ausschließliches Nutzungsrecht. </p> <p>Der Urheber/die Urheberin der Forschungsdaten verpflichtet sich, die Universität Osnabrück von solchen Ansprüchen Dritter freizustellen, die sich daraus ergeben, dass es aufgrund schuldhafter falscher Angaben des Urhebers/der Urheberin bezüglich des Nichtbestehens von Rechten Dritter oder sonstiger von ihm/ihr zu vertretenden Umständen durch die Veröffentlichung seines/ihres Werkes auf <i>osnaData</i> zu einer Verletzung von Urheberrechten oder ausschließlichen Nutzungsrechten kommt. Das gilt nicht, wenn die Verletzung auf einem vorsätzlichen oder grob fahrlässigen Verhalten der Universität Osnabrück als Betreiberin von <i>osnaData</i> beruht und dem Urheber/der Urheberin der Forschungsdaten nicht in gleicher Weise Vorsatz oder grobe Fahrlässigkeit zu Last fällt. Im letzteren Fall erfolgt eine Aufteilung des Schadens insbesondere unter Abwägung der Verschuldensanteile. </p> <p>Die Vertragsparteien verpflichten sich, einander unverzüglich zu informieren, wenn Dritte Ansprüche aufgrund der ihnen zustehenden Urheber- bzw. Nutzungsrechte an den digitalen Forschungsdaten gegen sie erheben. </p> <p>Die Universität Osnabrück ist berechtigt, den Zugriff auf die Forschungsdaten zu sperren, soweit konkrete Anhaltspunkte für eine Verletzung von Rechten Dritter bestehen oder andere rechtliche Vorschriften dies erfordern. </p> <h4>Langzeitarchivierung und Transformation in andere Formate </h4> <p>Der Urheber/die Urheberin der Forschungsdaten räumt der Universität Osnabrück im Rahmen der Rechteeinräumung gemäß Ziffer 1 das Recht ein, seine/ihre bereitgestellten Forschungsdaten in einem Langzeitarchiv zu speichern und bei Bedarf (z. B. technische Nutzbarkeit, Migration, Barrierefreiheit, bessere Zugänglichkeit oder Erschließung) in andere elektronische Formate zu überführen (Formatkonvertierung). </p> <h4>Weitergabe von Metadaten und Dokumenten </h4> <p>Der Urheber/die Urheberin der Forschungsdaten räumt der Universität Osnabrück im Rahmen der Rechteeinräumung gemäß Ziffer 1 das Recht ein, die Metadaten einschließlich Abstract seiner/ihrer Forschungsdaten anderen Datenbanken gemäß den FAIR-Prinzipien  unentgeltlich unter der Lizenz CC0 zur Verfügung zu stellen. Darüber hinaus räumt er/sie der Universität Osnabrück das Recht ein, seine/ihre Forschungsdaten Dritten im Rahmen nationaler Sammelaufträge zur Online-Bereitstellung oder Archivierung zur Verfügung zu stellen. </p> <p>Die durch diesen Vertrag eingeräumten Rechte können ganz oder teilweise auf Dritte übertragen und einfache Nutzungsrechte an andere Repositorien vergeben bzw. ein Dritter mit der Bereitstellung des Dokuments beauftragt werden, ohne dass es hierzu einer gesonderten Zustimmung des Urhebers/der Urheberin der Forschungsdaten bedarf. </p> <p><b>Ansprechpartner für alle <i>osnaData</i> betreffenden technischen und inhaltlichen Fragen ist die Administration von <i>osnaData</i>. 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Tom, 2025, \"Replikationsdaten für: Comparison of the diversity of prokaryotic communities between agricultural and uncultivated soils in the Osnabrück region\", https://doi.org/10.26249/FK2/TSVDUS, osnaData, V1"}}